Authors: Suwannasing R, Duangjinda M, Boonkum W, Taharnklaew R, Tuangsithtanon K
(Contact: monchai@kku.ac.th ) Affiliation: Betagro Hybrid International Company Limited, Bangkok 10210, Thailand Title: The identification of novel regions for reproduction trait in Landrace and Large White pigs using a single step genome-wide association study Journal: Asian-Australasian Journal Of Animal Sciences, 31(12): 1852-1862 (2018)
DOI :
10.5713/ajas.18.0072 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Offspring number
Chr.X : Asso:171398 , Asso:171399 , Asso:171400 , Asso:171401 , Asso:171402 , Asso:171408 , Asso:171409 , Asso:171410 , Asso:171411 , Asso:171412 , Asso:171413 , Asso:171441 , Asso:171442 , Asso:171443 , Asso:171444 , Asso:171445 . Chr.1 : Asso:171393 , Asso:171394 , Asso:171395 , Asso:171396 , Asso:171397 , Asso:171403 , Asso:171404 , Asso:171405 , Asso:171406 , Asso:171407 , Asso:171436 , Asso:171437 , Asso:171438 , Asso:171439 , Asso:171440 . Chr.2 : Asso:171333 , Asso:171334 , Asso:171335 , Asso:171336 , Asso:171344 , Asso:171345 , Asso:171346 , Asso:171347 , Asso:171348 , Asso:171379 . Chr.6 : Asso:171337 , Asso:171338 , Asso:171339 , Asso:171340 , Asso:171341 , Asso:171349 , Asso:171350 , Asso:171351 , Asso:171352 , Asso:171353 , Asso:171354 , Asso:171355 , Asso:171356 , Asso:171357 , Asso:171380 , Asso:171381 , Asso:171382 , Asso:171383 , Asso:171384 . Chr.14 : Asso:171342 , Asso:171343 .
QTL for Weaning to conception interval
Chr.X : Asso:171367 , Asso:171368 , Asso:171369 , Asso:171370 , Asso:171419 , Asso:171420 , Asso:171421 , Asso:171422 , Asso:171423 , Asso:171424 . Chr.1 : Asso:171414 , Asso:171415 , Asso:171416 , Asso:171417 , Asso:171418 . Chr.2 : Asso:171358 , Asso:171359 , Asso:171360 , Asso:171361 . Chr.6 : Asso:171362 , Asso:171363 , Asso:171364 , Asso:171365 , Asso:171366 .
QTL for Number of litters
Chr.X : Asso:171376 , Asso:171377 , Asso:171378 , Asso:171431 , Asso:171432 , Asso:171433 , Asso:171434 , Asso:171435 . Chr.1 : Asso:171425 , Asso:171426 , Asso:171427 , Asso:171428 , Asso:171429 . Chr.2 : Asso:171371 , Asso:171372 , Asso:171373 , Asso:171374 , Asso:171375 . Chr.18 : Asso:171430 .
QTL for Number of non-productive days
Chr.X : Asso:171390 , Asso:171391 , Asso:171392 , Asso:171452 , Asso:171453 , Asso:171454 , Asso:171455 , Asso:171456 , Asso:171457 , Asso:171458 , Asso:171459 , Asso:171460 , Asso:171461 . Chr.1 : Asso:171446 , Asso:171447 , Asso:171448 , Asso:171449 , Asso:171450 . Chr.2 : Asso:171385 , Asso:171386 , Asso:171387 , Asso:171388 , Asso:171389 . Chr.18 : Asso:171451 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Suwannasing R, Duangjinda M, Boonkum W, Taharnklaew R, Tuangsithtanon K (2018). The identification of novel regions for reproduction trait in Landrace and Large White pigs using a single step genome-wide association study. Asian-Australasian journal of animal sciences, 31(12): 1852-1862;
Curated into QTLdb on 2019-05-22. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=DqUw6E3ZfK
OR
Suwannasing R, Duangjinda M, Boonkum W, Taharnklaew R, Tuangsithtanon K (2018). The identification of novel regions for reproduction trait in Landrace and Large White pigs using a single step genome-wide association study. Asian-Australasian journal of animal sciences, 31(12): 1852-1862; DOI: https://dx.doi.org/10.5713/ajas.18.0072
