Authors: Singh A, Kumar A, Gondro C, da Silva Romero AR, Karthikeyan A, Mehrotra A, Pandey AK, Dutt T, Mishra BP
(Contact: vetamitchandan07@gmail.com ) Affiliation: Animal Genetics Division, ICAR-Indian Veterinary Research Institute, Izatnagar, Bareilly, India Title: Identification of genes affecting milk fat and fatty acid composition in Vrindavani crossbred cattle using 50 K SNP-Chip Journal: Tropical Animal Health And Production, 53(3): 347 (2021)
DOI :
10.1007/s11250-021-02795-z Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk stearic acid content
Chr.1 : Asso:224540 . Chr.3 : Asso:224507 , Asso:224511 , Asso:224512 , Asso:224533 , Asso:224537 . Chr.4 : Asso:224547 . Chr.5 : Asso:224508 , Asso:224506 , Asso:224535 . Chr.6 : Asso:224534 , Asso:224541 . Chr.9 : Asso:224536 , Asso:224542 . Chr.11 : Asso:224538 . Chr.12 : Asso:224514 , Asso:224546 . Chr.14 : Asso:224509 , Asso:224539 . Chr.20 : Asso:224544 . Chr.21 : Asso:224545 . Chr.23 : Asso:224513 . Chr.24 : Asso:224543 . Chr.25 : Asso:224510 .
QTL for Milk palmitic acid content
Chr.4 : Asso:224505 , Asso:224504 , Asso:224502 , Asso:224503 , Asso:224525 , Asso:224526 , Asso:224527 , Asso:224530 . Chr.7 : Asso:224531 . Chr.17 : Asso:224528 . Chr.23 : Asso:224532 . Chr.24 : Asso:224529 .
QTL for Milk myristic acid content
Chr.4 : Asso:224499 , Asso:224497 , Asso:224496 , Asso:224453 , Asso:224454 , Asso:224452 , Asso:224451 . Chr.7 : Asso:224498 . Chr.10 : Asso:224500 , Asso:224501 , Asso:224495 , Asso:224455 .
QTL for Milk lauric acid content
Chr.3 : Asso:224494 , Asso:224493 , Asso:224488 , Asso:224489 , Asso:224450 . Chr.7 : Asso:224491 , Asso:224490 , Asso:224487 . Chr.11 : Asso:224492 .
QTL for Milk capric acid content
Chr.7 : Asso:224484 , Asso:224483 , Asso:224449 . Chr.22 : Asso:224485 . Chr.25 : Asso:224486 .
QTL for Milk caprylic acid content
Chr.1 : Asso:224477 . Chr.3 : Asso:224478 . Chr.6 : Asso:224448 . Chr.7 : Asso:224470 . Chr.8 : Asso:224474 , Asso:224473 . Chr.14 : Asso:224475 . Chr.20 : Asso:224482 , Asso:224480 , Asso:224481 , Asso:224472 , Asso:224471 , Asso:224447 . Chr.21 : Asso:224479 , Asso:224476 . Chr.28 : Asso:224446 , Asso:224445 .
QTL for Milk caproic acid content
Chr.1 : Asso:224464 . Chr.3 : Asso:224467 , Asso:224465 , Asso:224460 , Asso:224440 . Chr.4 : Asso:224469 , Asso:224463 , Asso:224462 . Chr.5 : Asso:224456 . Chr.12 : Asso:224457 , Asso:224441 . Chr.14 : Asso:224468 . Chr.15 : Asso:224459 , Asso:224458 , Asso:224444 , Asso:224443 , Asso:224442 . Chr.21 : Asso:224466 . Chr.29 : Asso:224461 .
QTL for Milk arachidic acid content
Chr.3 : Asso:224555 . Chr.4 : Asso:224554 . Chr.5 : Asso:224518 , Asso:224553 . Chr.11 : Asso:224551 . Chr.14 : Asso:224548 , Asso:224549 , Asso:224552 . Chr.15 : Asso:224550 . Chr.21 : Asso:224517 . Chr.24 : Asso:224515 . Chr.25 : Asso:224516 .
QTL for Milk tetracosanoic acid content
Chr.11 : Asso:224557 . Chr.14 : Asso:224523 , Asso:224524 . Chr.19 : Asso:224559 . Chr.22 : Asso:224556 , Asso:224560 . Chr.26 : Asso:224519 , Asso:224520 , Asso:224521 , Asso:224522 , Asso:224558 .
QTL for Milk fat percentage
Chr.14 : Asso:224561 , Asso:224562 , Asso:224563 , Asso:224564 , Asso:224565 , Asso:224566 , Asso:224567 , Asso:224568 , Asso:224569 , Asso:224570 , Asso:224571 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (3) ,
Chr.3 (16) ,
Chr.4 (20) ,
Chr.5 (6) ,
Chr.6 (3) ,
Chr.7 (9) ,
Chr.8 (2) ,
Chr.9 (2) ,
Chr.10 (4) ,
Chr.11 (4) ,
Chr.12 (4) ,
Chr.14 (20) ,
Chr.15 (6) ,
Chr.17 (1) ,
Chr.19 (1) ,
Chr.20 (7) ,
Chr.21 (5) ,
Chr.22 (3) ,
Chr.23 (2) ,
Chr.24 (3) ,
Chr.25 (3) ,
Chr.26 (5) ,
Chr.28 (2) ,
Chr.29 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Singh A, Kumar A, Gondro C, da Silva Romero AR, Karthikeyan A, Mehrotra A, Pandey AK, Dutt T, Mishra BP (2021). Identification of genes affecting milk fat and fatty acid composition in Vrindavani crossbred cattle using 50 K SNP-Chip. Tropical animal health and production, 53(3): 347;
Curated into QTLdb on 2021-08-25. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=MhUx2F3DhL
OR
Singh A, Kumar A, Gondro C, da Silva Romero AR, Karthikeyan A, Mehrotra A, Pandey AK, Dutt T, Mishra BP (2021). Identification of genes affecting milk fat and fatty acid composition in Vrindavani crossbred cattle using 50 K SNP-Chip. Tropical animal health and production, 53(3): 347; DOI: https://dx.doi.org/10.1007/s11250-021-02795-z
